Die Jackcontrol AG wurde 2004 als Spin-off-Unternehmung der ETH Zürich gegründet. Dabei sollten aktuelle Erkenntnisse über das Tragverhalten von Stahlbetonvortriebsrohren aus der Dissertation von Dr. Stefan Trümpi-Althaus in die Praxis umgesetzt werden. 2005 konnten für die Stadt Zürich mit dem Jackcontrol^®-Gesamtleistungspaket und der Hydraulischen Fuge erste Aufträge ausgeführt werden, gefolgt von Aufträgen in weiteren Städten der Schweiz. Aufgrund der gemachten ersten praktischen Erfahrungen konnte das System weiter verbessert und das Anwendungspektrum mit der Einführung des heute mehrheitlich eingesetzten P-Type entscheidend erweitert werden. 2007 konnten in Deutschland erste Auslandaufträge akquiriert werden. 2008 erfolgten erste Aufträge in Russland. In diesem Jahr erfolgte auch die Übernahme der Ingenieurbüro Runge AG, Glarus, auf deren Personal und Infrastruktur schon seit Gründung der Jackcontrol AG zurückgegriffen werden konnte. 2009 wurde in der Werkstätte Buchholz/Glarus der firmeneigene Fugenprüfstand eingerichtet, mittels welchem unter anderem der neue JCPipe^®-Algorithmus entwickelt werden konnte, welcher 2009 eingeführt wurde. 2010 erfolgte der Umzug in das neue, moderne Büro an der Buchholzstrasse in Glarus.

Ab 2006 erfolgte die Erneuerung des Kraftwerks der Hefti Hätzingen AG mit Inbetriebnahme im Sommer 2007. Dies war der Anfang einer Erfolgsgeschichte im Kraftwerksbau, gefolgt von zahlreichen weiteren Kraftwerksprojekten. So wurden 2009 das Hochdruckwasserkraftwerk Mühlebach in Engi und 2010 das Flusskraftwerk Mühlefuhr in Ennenda erfolgreich in Betrieb genommen. Zahlreiche weitere, immer grössere und anspruchsvollere Projekte für neue Bauherrschaften konnten akquiriert werden und der Bereich Wasserkraftwerksbau entwickelte sich zu einem zweiten Standbein der Jackcontrol AG.